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ATAC-seq测序与分析

ATAC-seq测序与分析

简要描述:染色质开放性是指真核生物染色质和组蛋白、转录因子等是否结合的开放程度,这一特性与染色质转录活跃程度相关,从而能够揭示基因调控的机制。ATAC-seq测序与分析,即利用转座酶研究染色质可接近性的高通量测序,可以检测染色质开放区域,其原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质区域的特性,对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序和富集分析。

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所属分类:高通量测序与分析

更新时间:2021-09-16

厂商性质:生产厂家

详情介绍

ATAC-seq测序与分析

染色质开放性是指真核生物染色质和组蛋白、转录因子等是否结合的开放程度,这一特性与染色质转录活跃程度相关,从而能够揭示基因调控的机制。ATAC-seq测序与分析(Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing),即利用转座酶研究染色质可接近性的高通量测序,可以检测染色质开放区域,其原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质区域的特性,对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序和富集分析。

ATAC.png

实验原理


ATAC-seq技术流程.png

技术路线


ATAC分析内容.png

分析内容


技术优势
  • 常量样本至少需要5万个细胞,微量样本低至100个细胞(适用于稀有样本)
  • 技术重复性好,成功率高
  • 实验步骤简单,周期短
  • 获得信息量大(全基因组开放染色质区域)
物种经验


  • 多物种:多种动植物、模式生物和非模式生物
  • 多器官组织类型:健康器官、疾病模型组织
  • 多样品类型:新鲜、冻存、固定

研究应用

  • 染色体开放性图谱绘制(所有物种适用)

  • 胚胎发育表观遗传修饰(胚胎学发育研究)

  • 肿瘤发生表观机制研究(肿瘤标记及病理研究)

  • 疾病潜在标志物的预测(病理及生物标记)

  • 肿瘤异质性或分型研究(肿瘤分型与微环境研究)

  • 作物表观修饰差异研究(包括水稻、玉米、小麦等)


公司简介

上海昆盟生物科技有限公司 (Coweldgen Scientific Co,.LTD) 是一家专注于生命科学领域提供相关试剂产品和服务的生物高科技企业,坐落于上海聚科生物产业园。公司提供种类齐全的细胞系和多种原代细胞、质量稳定的细胞培养试剂产品、成熟高效的技术服务。本着“守正创新,科学严谨"的理念,我们以高标准塑造行业品牌,以全新视野构建现代企业,勇于探索和创新。公司业务范围涉及全国各省市自治区,与国内多家医院、高校、科研院所、生物科技公司建立了良好的合作关系,赢得了良好的市场声誉和广泛的认可,我们保证将继续为广大科研用户提供专业、高效、优质的产品及服务!

细胞系(带STR鉴定) | 原代细胞 | 细胞培养基 | 血清 | 细胞培养添加因子 | 标记细胞 | 耐药细胞 | 生化检测试剂盒 | WB试剂 | 抗体 等;ATAC-seq分析 | ChIP-seq分析 | 16S rRNA测序分析 | Pull down实验 | RIP 实验 | ChIP实验 | Co-IP实验 | 质谱检测 | WB检测 | PCR检测 | 细胞培养/增殖/凋亡/周期/迁移/侵袭/自噬 | 活体成像 | 免疫组化 | 电镜检测 | micro-CT 检测  等。

更多信息,欢迎垂询上海昆盟生物科技有限公司。



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