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ChIP-Seq测序与分析

ChIP-Seq测序与分析

简要描述:ChIP-Seq测序与分析 是指通过染色质免疫共沉淀技术特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化和文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序,通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的 DNA 区段信息,是目前在全基因组水平研究蛋白结合靶DNA序列的重要手段,为转录因子、组蛋白修饰、核小体定位等表观遗传学的研究提供有效方法。

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所属分类:高通量测序与分析

更新时间:2021-09-16

厂商性质:代理商

详情介绍

ChIP-Seq测序与分析

ChIP-Seq测序与分析 是指通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA 片段,并对其进行纯化和文库构建;然后富集得到的DNA 片段进行高通量测序,通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的 DNA 区段信息,是目前在全基因组水平研究蛋白结合靶DNA序列的重要手段,为转录因子、组蛋白修饰、核小体定位等表观遗传学的研究提供有效方法。其将染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)与高通量测序(Sequencing)技术相结合,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典实验方法。

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实验流程


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分析流程


该技术的主要优势:

1) 全基因组覆盖:ChIP-seq相较于传统的ChIP芯片,能够实现全基因组范围的、单碱基水平的蛋白结合位点筛选与鉴定;

2) 高灵敏度:每个样本可获得数百万条的序列标签,可发现研究基因组上稀有的蛋白结合位点;

3) 高精确率:可获得高水平的信噪比数据,准确区分真实事件与噪音,精确定位蛋白结合位点。


该技术在基础研究中的应用:

1) 应用于转录因子结合位点的研究:ChIP-seq技术广泛应用于与转录因子相关的生物学作用与相关机制的研究。分析转录因子在不同细胞、不同状态下所发挥的作用;

2) 应用于组蛋白修饰的研究:ChIP-seq技术亦常应用于研究组蛋白的修饰分布,通过观察组蛋白修饰的分布情况,进一步明确组蛋白修饰所发挥的生物学作用;

3) 应用于核小体定位研究:运用ChIP-seq技术研究核小体的分布规律,进而分析得知核小体对基因表达所产生的影响。


公司简介

上海昆盟生物科技有限公司 (Coweldgen Scientific Co.,LTD) 是一家专注于生命科学领域提供相关试剂产品和服务的生物高科技企业,坐落于上海聚科生物产业园。公司提供种类齐全的细胞系和多种原代细胞、质量稳定的细胞培养试剂产品、成熟高效的技术服务。本着“守正创新,科学严谨"的理念,我们以高标准塑造行业品牌,以全新视野构建现代企业,勇于探索和创新。公司业务范围涉及全国各省市自治区,与国内多家医院、高校、科研院所、生物科技公司建立了良好的合作关系,赢得了良好的市场声誉和广泛的认可,我们保证将继续为广大科研用户提供专业、高效、优质的产品及服务!

细胞系(带STR鉴定) | 原代细胞 | 细胞培养基 | 血清 | 细胞培养添加因子 | 标记细胞 | 耐药细胞 | 生化检测试剂盒 | WB试剂 | 抗体 等;ATAC-seq分析 | ChIP-seq分析 | 16S rRNA测序分析 | Pull down实验 | RIP 实验 | ChIP实验 | Co-IP实验 | 质谱检测 | WB检测 | PCR检测 | 细胞培养/增殖/凋亡/周期/迁移/侵袭/自噬 | 活体成像 | 免疫组化 | 电镜检测 | micro-CT 检测  等。

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